Protein–RNA interactions for Protein: P84751

Ig heavy chain Mem5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P84751 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P84751 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P84751 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P84751 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P84751 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P84751 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P84751 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P84751 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P84751 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P84751 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P84751 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P84751 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P84751 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P84751 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P84751 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P84751 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P84751 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P84751 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P84751 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P84751 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P84751 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P84751 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P84751 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P84751 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P84751 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P84751 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P84751 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P84751 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P84751 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P84751 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P84751 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P84751 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P84751 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P84751 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P84751 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P84751 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P84751 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P84751 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P84751 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P84751 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P84751 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P84751 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P84751 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P84751 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P84751 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P84751 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P84751 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P84751 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P84751 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P84751 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P84751 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P84751 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P84751 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P84751 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P84751 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P84751 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P84751 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P84751 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P84751 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P84751 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P84751 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P84751 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P84751 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P84751 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P84751 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P84751 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P84751 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P84751 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P84751 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P84751 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P84751 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P84751 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P84751 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P84751 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P84751 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P84751 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P84751 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P84751 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P84751 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P84751 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P84751 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P84751 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P84751 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P84751 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P84751 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P84751 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P84751 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P84751 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms