Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H3f3aP84244 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3f3aP84244 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3f3aP84244 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
H3f3aP84244 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms