Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptprn2P80560 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptprn2P80560 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptprn2P80560 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms