Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cct7P80313 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cct7P80313 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cct7P80313 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cct7P80313 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cct7P80313 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cct7P80313 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cct7P80313 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cct7P80313 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cct7P80313 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cct7P80313 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cct7P80313 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms