Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfi1P70338 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfi1P70338 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms