Protein–RNA interactions for Protein: P70248

Myo1f, Unconventional myosin-If, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1fP70248 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo1fP70248 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo1fP70248 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1fP70248 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo1fP70248 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms