Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrig1P70193 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig1P70193 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig1P70193 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms