Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,02■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,01■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC48,01■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,98■■■■■ 5,27
Abcc9P70170 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,98■■■■■ 5,27
Abcc9P70170 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,97■■■■■ 5,27
Abcc9P70170 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,96■■■■■ 5,27
Abcc9P70170 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC47,96■■■■■ 5,27
Abcc9P70170 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC47,96■■■■■ 5,27
Abcc9P70170 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC47,96■■■■■ 5,27
Abcc9P70170 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,95■■■■■ 5,27
Abcc9P70170 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,94■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC47,93■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC47,93■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC47,93■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,93■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,93■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47,92■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC47,92■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC47,92■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC47,92■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,92■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC47,92■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC47,91■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC47,91■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,9■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC47,9■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47,9■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC47,9■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,89■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,88■■■■■ 5,26
Abcc9P70170 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,87■■■■■ 5,25
Abcc9P70170 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,87■■■■■ 5,25
Abcc9P70170 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,86■■■■■ 5,25
Abcc9P70170 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC47,85■■■■■ 5,25
Abcc9P70170 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47,84■■■■■ 5,25
Abcc9P70170 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,84■■■■■ 5,25
Abcc9P70170 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47,84■■■■■ 5,25
Abcc9P70170 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC47,82■■■■■ 5,25
Abcc9P70170 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC47,81■■■■■ 5,24
Abcc9P70170 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,8■■■■■ 5,24
Abcc9P70170 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC47,8■■■■■ 5,24
Abcc9P70170 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC47,79■■■■■ 5,24
Abcc9P70170 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,79■■■■■ 5,24
Abcc9P70170 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,79■■■■■ 5,24
Abcc9P70170 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,78■■■■■ 5,24
Abcc9P70170 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,77■■■■■ 5,24
Abcc9P70170 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC47,76■■■■■ 5,24
Abcc9P70170 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,75■■■■■ 5,23
Abcc9P70170 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC47,75■■■■■ 5,23
Abcc9P70170 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC47,75■■■■■ 5,23
Abcc9P70170 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,74■■■■■ 5,23
Abcc9P70170 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC47,73■■■■■ 5,23
Abcc9P70170 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC47,72■■■■■ 5,23
Abcc9P70170 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC47,72■■■■■ 5,23
Abcc9P70170 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC47,72■■■■■ 5,23
Abcc9P70170 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47,71■■■■■ 5,23
Abcc9P70170 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC47,7■■■■■ 5,23
Abcc9P70170 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,68■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,68■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47,67■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC47,65■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,65■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC47,65■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,65■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,64■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC47,64■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC47,64■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47,64■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC47,63■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC47,63■■■■■ 5,22
Abcc9P70170 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC47,63■■■■■ 5,21
Abcc9P70170 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,63■■■■■ 5,21
Abcc9P70170 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC47,62■■■■■ 5,21
Abcc9P70170 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC47,61■■■■■ 5,21
Abcc9P70170 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC47,59■■■■■ 5,21
Abcc9P70170 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47,59■■■■■ 5,21
Abcc9P70170 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC47,57■■■■■ 5,21
Abcc9P70170 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC47,57■■■■■ 5,21
Abcc9P70170 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC47,56■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47,56■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC47,55■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC47,55■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,55■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,55■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC47,54■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC47,53■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47,52■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC47,52■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,51■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,51■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,51■■■■■ 5,2
Abcc9P70170 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC47,49■■■■■ 5,19
Abcc9P70170 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC47,48■■■■■ 5,19
Abcc9P70170 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,47■■■■■ 5,19
Abcc9P70170 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,46■■■■■ 5,19
Abcc9P70170 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,45■■■■■ 5,19
Abcc9P70170 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC47,44■■■■■ 5,19
Abcc9P70170 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,44■■■■■ 5,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,9 ms