Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
Abcc9P70170 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Abcc9P70170 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
Abcc9P70170 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.28
Abcc9P70170 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
Abcc9P70170 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
Abcc9P70170 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
Abcc9P70170 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
Abcc9P70170 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Abcc9P70170 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Abcc9P70170 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Abcc9P70170 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
Abcc9P70170 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC47.93■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC47.93■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC47.93■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC47.91■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.9■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
Abcc9P70170 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Abcc9P70170 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
Abcc9P70170 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
Abcc9P70170 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC47.85■■■■■ 5.25
Abcc9P70170 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.84■■■■■ 5.25
Abcc9P70170 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Abcc9P70170 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
Abcc9P70170 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC47.82■■■■■ 5.25
Abcc9P70170 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC47.81■■■■■ 5.24
Abcc9P70170 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
Abcc9P70170 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
Abcc9P70170 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Abcc9P70170 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Abcc9P70170 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Abcc9P70170 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
Abcc9P70170 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
Abcc9P70170 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
Abcc9P70170 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
Abcc9P70170 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC47.75■■■■■ 5.23
Abcc9P70170 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC47.75■■■■■ 5.23
Abcc9P70170 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
Abcc9P70170 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Abcc9P70170 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Abcc9P70170 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
Abcc9P70170 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC47.72■■■■■ 5.23
Abcc9P70170 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
Abcc9P70170 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC47.7■■■■■ 5.23
Abcc9P70170 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC47.63■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC47.63■■■■■ 5.22
Abcc9P70170 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.21
Abcc9P70170 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.63■■■■■ 5.21
Abcc9P70170 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC47.62■■■■■ 5.21
Abcc9P70170 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC47.61■■■■■ 5.21
Abcc9P70170 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC47.59■■■■■ 5.21
Abcc9P70170 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
Abcc9P70170 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
Abcc9P70170 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC47.57■■■■■ 5.21
Abcc9P70170 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC47.55■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC47.55■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.52■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC47.52■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Abcc9P70170 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC47.49■■■■■ 5.19
Abcc9P70170 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC47.48■■■■■ 5.19
Abcc9P70170 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
Abcc9P70170 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Abcc9P70170 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
Abcc9P70170 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.19
Abcc9P70170 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms