Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkcbP68404 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkcbP68404 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms