Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp3P63024 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp3P63024 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms