Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabra1P62812 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra1P62812 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra1P62812 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra1P62812 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra1P62812 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra1P62812 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra1P62812 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra1P62812 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra1P62812 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra1P62812 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra1P62812 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabra1P62812 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms