Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsc22d1P62500 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc22d1P62500 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc22d1P62500 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc22d1P62500 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc22d1P62500 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc22d1P62500 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc22d1P62500 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc22d1P62500 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms