Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp46P62069 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp46P62069 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp46P62069 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp46P62069 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp46P62069 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp46P62069 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp46P62069 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp46P62069 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp46P62069 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp46P62069 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms