Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d1P61080 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2d1P61080 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms