Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdo1P60334 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdo1P60334 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdo1P60334 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms