Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rin3P59729 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rin3P59729 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rin3P59729 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rin3P59729 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rin3P59729 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rin3P59729 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rin3P59729 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rin3P59729 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rin3P59729 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rin3P59729 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rin3P59729 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rin3P59729 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rin3P59729 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rin3P59729 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rin3P59729 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rin3P59729 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms