Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd4P58467 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd4P58467 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd4P58467 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd4P58467 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd4P58467 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd4P58467 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd4P58467 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd4P58467 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms