Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpaP58389 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpaP58389 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpaP58389 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpaP58389 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpaP58389 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpaP58389 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpaP58389 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpaP58389 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpaP58389 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpaP58389 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpaP58389 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpaP58389 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpaP58389 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtpaP58389 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpaP58389 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpaP58389 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms