Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uchl4P58321 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uchl4P58321 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uchl4P58321 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms