Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dpf3P58269 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dpf3P58269 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dpf3P58269 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dpf3P58269 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms