Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NcstnP57716 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NcstnP57716 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcstnP57716 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcstnP57716 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcstnP57716 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcstnP57716 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcstnP57716 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcstnP57716 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NcstnP57716 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcstnP57716 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcstnP57716 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms