Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp5P56399 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Usp5P56399 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp5P56399 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp5P56399 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp5P56399 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp5P56399 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp5P56399 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp5P56399 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp5P56399 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp5P56399 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp5P56399 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp5P56399 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp5P56399 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms