Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CartptP56388 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CartptP56388 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CartptP56388 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CartptP56388 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CartptP56388 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CartptP56388 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CartptP56388 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CartptP56388 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CartptP56388 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CartptP56388 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CartptP56388 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CartptP56388 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CartptP56388 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CartptP56388 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CartptP56388 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CartptP56388 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CartptP56388 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CartptP56388 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CartptP56388 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CartptP56388 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CartptP56388 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CartptP56388 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CartptP56388 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CartptP56388 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CartptP56388 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CartptP56388 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CartptP56388 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CartptP56388 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CartptP56388 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CartptP56388 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CartptP56388 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CartptP56388 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CartptP56388 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CartptP56388 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CartptP56388 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CartptP56388 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CartptP56388 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CartptP56388 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CartptP56388 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CartptP56388 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CartptP56388 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CartptP56388 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CartptP56388 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CartptP56388 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CartptP56388 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CartptP56388 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CartptP56388 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CartptP56388 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CartptP56388 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CartptP56388 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CartptP56388 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CartptP56388 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CartptP56388 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CartptP56388 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CartptP56388 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CartptP56388 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CartptP56388 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CartptP56388 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CartptP56388 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CartptP56388 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CartptP56388 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CartptP56388 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CartptP56388 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CartptP56388 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CartptP56388 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CartptP56388 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CartptP56388 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CartptP56388 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CartptP56388 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CartptP56388 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CartptP56388 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CartptP56388 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CartptP56388 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CartptP56388 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CartptP56388 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CartptP56388 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CartptP56388 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CartptP56388 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CartptP56388 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CartptP56388 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CartptP56388 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CartptP56388 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CartptP56388 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CartptP56388 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CartptP56388 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CartptP56388 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CartptP56388 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CartptP56388 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CartptP56388 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CartptP56388 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CartptP56388 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CartptP56388 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CartptP56388 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CartptP56388 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CartptP56388 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CartptP56388 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CartptP56388 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CartptP56388 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CartptP56388 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms