Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pex2P55098 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pex2P55098 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pex2P55098 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pex2P55098 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pex2P55098 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pex2P55098 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pex2P55098 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pex2P55098 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pex2P55098 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pex2P55098 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pex2P55098 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms