Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nub1P54729 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nub1P54729 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nub1P54729 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nub1P54729 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nub1P54729 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nub1P54729 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nub1P54729 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nub1P54729 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nub1P54729 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nub1P54729 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nub1P54729 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nub1P54729 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nub1P54729 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms