Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pms2P54279 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pms2P54279 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pms2P54279 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pms2P54279 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pms2P54279 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pms2P54279 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pms2P54279 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pms2P54279 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pms2P54279 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pms2P54279 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms