Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgf9P54130 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fgf9P54130 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fgf9P54130 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms