Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc1a1P51906 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a1P51906 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc1a1P51906 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms