Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccr4P51680 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr4P51680 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr4P51680 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccr4P51680 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccr4P51680 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccr4P51680 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccr4P51680 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr4P51680 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr4P51680 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr4P51680 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccr4P51680 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccr4P51680 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccr4P51680 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms