Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XpcP51612 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XpcP51612 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XpcP51612 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XpcP51612 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XpcP51612 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XpcP51612 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XpcP51612 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XpcP51612 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XpcP51612 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XpcP51612 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XpcP51612 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
XpcP51612 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XpcP51612 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XpcP51612 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
XpcP51612 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XpcP51612 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XpcP51612 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XpcP51612 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XpcP51612 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XpcP51612 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XpcP51612 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XpcP51612 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XpcP51612 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XpcP51612 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
XpcP51612 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XpcP51612 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XpcP51612 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XpcP51612 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XpcP51612 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
XpcP51612 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XpcP51612 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XpcP51612 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XpcP51612 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XpcP51612 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XpcP51612 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XpcP51612 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XpcP51612 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XpcP51612 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XpcP51612 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XpcP51612 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XpcP51612 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XpcP51612 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XpcP51612 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
XpcP51612 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XpcP51612 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XpcP51612 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XpcP51612 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XpcP51612 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XpcP51612 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XpcP51612 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XpcP51612 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XpcP51612 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XpcP51612 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
XpcP51612 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XpcP51612 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
XpcP51612 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XpcP51612 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XpcP51612 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XpcP51612 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XpcP51612 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XpcP51612 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
XpcP51612 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XpcP51612 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XpcP51612 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XpcP51612 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XpcP51612 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XpcP51612 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XpcP51612 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
XpcP51612 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XpcP51612 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
XpcP51612 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XpcP51612 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
XpcP51612 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
XpcP51612 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XpcP51612 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
XpcP51612 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XpcP51612 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XpcP51612 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XpcP51612 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XpcP51612 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XpcP51612 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XpcP51612 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
XpcP51612 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XpcP51612 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XpcP51612 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XpcP51612 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XpcP51612 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XpcP51612 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XpcP51612 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms