Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,46■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Defa13P50711 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16,45■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,45■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,45■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,41■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16,41■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16,4■□□□□ 0,22
Defa13P50711 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16,39■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defa13P50711 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16,36■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,21
Defa13P50711 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa13P50711 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms