Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa10P50708 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa10P50708 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa10P50708 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa10P50708 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa10P50708 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa10P50708 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa10P50708 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa10P50708 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms