Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FanccP50652 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FanccP50652 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FanccP50652 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FanccP50652 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FanccP50652 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FanccP50652 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FanccP50652 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FanccP50652 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FanccP50652 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FanccP50652 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FanccP50652 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FanccP50652 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FanccP50652 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FanccP50652 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FanccP50652 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FanccP50652 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FanccP50652 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FanccP50652 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FanccP50652 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FanccP50652 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FanccP50652 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FanccP50652 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FanccP50652 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FanccP50652 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FanccP50652 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FanccP50652 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FanccP50652 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FanccP50652 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FanccP50652 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FanccP50652 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FanccP50652 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FanccP50652 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FanccP50652 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FanccP50652 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FanccP50652 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FanccP50652 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FanccP50652 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FanccP50652 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FanccP50652 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FanccP50652 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FanccP50652 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FanccP50652 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FanccP50652 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FanccP50652 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FanccP50652 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FanccP50652 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FanccP50652 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FanccP50652 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FanccP50652 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FanccP50652 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FanccP50652 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FanccP50652 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FanccP50652 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FanccP50652 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FanccP50652 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FanccP50652 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FanccP50652 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FanccP50652 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FanccP50652 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FanccP50652 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FanccP50652 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FanccP50652 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FanccP50652 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FanccP50652 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FanccP50652 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FanccP50652 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FanccP50652 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FanccP50652 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FanccP50652 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FanccP50652 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FanccP50652 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FanccP50652 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FanccP50652 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FanccP50652 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FanccP50652 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FanccP50652 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FanccP50652 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FanccP50652 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FanccP50652 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FanccP50652 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FanccP50652 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FanccP50652 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FanccP50652 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FanccP50652 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FanccP50652 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FanccP50652 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FanccP50652 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FanccP50652 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FanccP50652 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FanccP50652 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FanccP50652 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FanccP50652 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FanccP50652 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FanccP50652 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FanccP50652 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FanccP50652 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FanccP50652 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FanccP50652 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FanccP50652 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms