Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LtbrP50284 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LtbrP50284 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LtbrP50284 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LtbrP50284 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LtbrP50284 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LtbrP50284 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LtbrP50284 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LtbrP50284 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LtbrP50284 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LtbrP50284 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LtbrP50284 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LtbrP50284 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LtbrP50284 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LtbrP50284 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LtbrP50284 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LtbrP50284 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms