Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
InaP46660 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
InaP46660 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
InaP46660 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
InaP46660 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
InaP46660 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
InaP46660 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
InaP46660 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
InaP46660 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
InaP46660 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
InaP46660 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
InaP46660 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
InaP46660 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
InaP46660 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
InaP46660 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
InaP46660 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
InaP46660 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
InaP46660 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
InaP46660 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
InaP46660 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
InaP46660 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
InaP46660 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
InaP46660 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
InaP46660 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
InaP46660 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
InaP46660 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
InaP46660 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
InaP46660 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
InaP46660 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
InaP46660 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
InaP46660 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
InaP46660 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
InaP46660 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
InaP46660 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
InaP46660 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
InaP46660 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
InaP46660 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
InaP46660 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
InaP46660 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
InaP46660 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
InaP46660 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
InaP46660 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
InaP46660 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
InaP46660 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
InaP46660 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
InaP46660 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
InaP46660 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
InaP46660 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
InaP46660 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
InaP46660 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
InaP46660 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
InaP46660 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
InaP46660 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
InaP46660 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
InaP46660 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
InaP46660 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
InaP46660 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
InaP46660 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
InaP46660 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
InaP46660 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
InaP46660 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
InaP46660 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
InaP46660 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
InaP46660 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
InaP46660 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
InaP46660 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
InaP46660 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
InaP46660 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
InaP46660 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
InaP46660 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
InaP46660 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
InaP46660 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
InaP46660 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
InaP46660 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
InaP46660 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
InaP46660 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
InaP46660 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
InaP46660 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
InaP46660 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
InaP46660 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
InaP46660 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
InaP46660 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
InaP46660 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
InaP46660 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
InaP46660 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
InaP46660 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
InaP46660 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
InaP46660 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
InaP46660 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
InaP46660 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
InaP46660 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
InaP46660 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
InaP46660 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
InaP46660 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
InaP46660 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
InaP46660 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
InaP46660 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
InaP46660 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
InaP46660 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
InaP46660 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms