Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sipa1P46062 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sipa1P46062 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sipa1P46062 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms