Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pik3caP42337 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3caP42337 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3caP42337 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3caP42337 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3caP42337 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3caP42337 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3caP42337 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3caP42337 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3caP42337 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms