Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbx1P41778 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pbx1P41778 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pbx1P41778 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pbx1P41778 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pbx1P41778 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pbx1P41778 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pbx1P41778 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pbx1P41778 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms