Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppm1bP36993 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1bP36993 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppm1bP36993 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppm1bP36993 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppm1bP36993 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppm1bP36993 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppm1bP36993 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms