Protein–RNA interactions for Protein: P35831

Ptpn12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn12P35831 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ptpn12P35831 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn12P35831 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptpn12P35831 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn12P35831 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms