Protein–RNA interactions for Protein: P35761

Ttk, Dual specificity protein kinase TTK, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtkP35761 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TtkP35761 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TtkP35761 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TtkP35761 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TtkP35761 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TtkP35761 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TtkP35761 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TtkP35761 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TtkP35761 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TtkP35761 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TtkP35761 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TtkP35761 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TtkP35761 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TtkP35761 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TtkP35761 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TtkP35761 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TtkP35761 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TtkP35761 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TtkP35761 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtkP35761 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TtkP35761 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtkP35761 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtkP35761 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtkP35761 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtkP35761 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TtkP35761 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TtkP35761 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TtkP35761 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TtkP35761 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TtkP35761 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TtkP35761 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TtkP35761 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TtkP35761 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TtkP35761 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TtkP35761 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtkP35761 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtkP35761 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TtkP35761 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtkP35761 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtkP35761 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtkP35761 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtkP35761 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtkP35761 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtkP35761 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtkP35761 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TtkP35761 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TtkP35761 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TtkP35761 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TtkP35761 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TtkP35761 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TtkP35761 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TtkP35761 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TtkP35761 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TtkP35761 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TtkP35761 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TtkP35761 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TtkP35761 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TtkP35761 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TtkP35761 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TtkP35761 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TtkP35761 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TtkP35761 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TtkP35761 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TtkP35761 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TtkP35761 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtkP35761 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtkP35761 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtkP35761 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtkP35761 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtkP35761 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtkP35761 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtkP35761 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtkP35761 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtkP35761 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TtkP35761 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TtkP35761 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TtkP35761 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TtkP35761 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TtkP35761 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TtkP35761 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TtkP35761 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TtkP35761 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtkP35761 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtkP35761 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtkP35761 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtkP35761 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtkP35761 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TtkP35761 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TtkP35761 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TtkP35761 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TtkP35761 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtkP35761 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtkP35761 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtkP35761 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtkP35761 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtkP35761 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtkP35761 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtkP35761 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtkP35761 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TtkP35761 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms