Protein–RNA interactions for Protein: P35294

Rab19, Ras-related protein Rab-19, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab19P35294 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab19P35294 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab19P35294 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab19P35294 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab19P35294 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab19P35294 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab19P35294 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab19P35294 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab19P35294 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab19P35294 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab19P35294 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab19P35294 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab19P35294 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab19P35294 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab19P35294 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms