Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sftpa1P35242 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sftpa1P35242 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sftpa1P35242 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sftpa1P35242 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sftpa1P35242 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sftpa1P35242 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sftpa1P35242 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sftpa1P35242 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sftpa1P35242 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sftpa1P35242 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sftpa1P35242 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sftpa1P35242 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sftpa1P35242 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sftpa1P35242 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sftpa1P35242 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sftpa1P35242 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms