Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccnd3P30282 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccnd3P30282 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnd3P30282 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnd3P30282 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms