Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Etv4P28322 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv4P28322 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv4P28322 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv4P28322 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv4P28322 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv4P28322 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Etv4P28322 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv4P28322 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv4P28322 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv4P28322 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv4P28322 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv4P28322 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv4P28322 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Etv4P28322 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv4P28322 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv4P28322 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv4P28322 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Etv4P28322 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Etv4P28322 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Etv4P28322 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Etv4P28322 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Etv4P28322 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Etv4P28322 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Etv4P28322 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Etv4P28322 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Etv4P28322 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv4P28322 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Etv4P28322 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv4P28322 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Etv4P28322 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv4P28322 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv4P28322 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv4P28322 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms