Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa3P28310 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa3P28310 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa3P28310 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa3P28310 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa3P28310 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa3P28310 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa3P28310 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa3P28310 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa3P28310 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa3P28310 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa3P28310 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa3P28310 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa3P28310 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa3P28310 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms