Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lef1P27782 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lef1P27782 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lef1P27782 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lef1P27782 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lef1P27782 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lef1P27782 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lef1P27782 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lef1P27782 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lef1P27782 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lef1P27782 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lef1P27782 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lef1P27782 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms