Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irf2P23906 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf2P23906 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf2P23906 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf2P23906 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf2P23906 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf2P23906 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf2P23906 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf2P23906 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2P23906 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf2P23906 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf2P23906 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf2P23906 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf2P23906 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf2P23906 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf2P23906 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf2P23906 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf2P23906 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf2P23906 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms