Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ggta1P23336 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ggta1P23336 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ggta1P23336 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ggta1P23336 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ggta1P23336 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms