Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkchP23298 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkchP23298 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrkchP23298 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkchP23298 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkchP23298 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkchP23298 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkchP23298 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkchP23298 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkchP23298 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkchP23298 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms